Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LcorlQ3U285 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LcorlQ3U285 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LcorlQ3U285 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LcorlQ3U285 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LcorlQ3U285 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LcorlQ3U285 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LcorlQ3U285 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LcorlQ3U285 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LcorlQ3U285 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LcorlQ3U285 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LcorlQ3U285 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms