Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Samd11Q1RNF8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms