Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PUM3Q15397 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
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