Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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Rpusd2Q149F1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98 ms