Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
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