Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps8Q0P5W1 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms