Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox13Q04891 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms