Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scg2Q03517 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms