Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcd1Q02242 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcd1Q02242 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms