Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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