Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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