Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms