Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx1P81068 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx1P81068 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx1P81068 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx1P81068 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx1P81068 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx1P81068 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx1P81068 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx1P81068 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms