Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Ptprn2P80560 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Ptprn2P80560 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Ptprn2P80560 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Ptprn2P80560 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Ptprn2P80560 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Ptprn2P80560 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
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Ptprn2P80560 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Ptprn2P80560 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Ptprn2P80560 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Ptprn2P80560 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms