Protein–RNA interactions for Protein: P61807

Snn, Stannin, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnnP61807 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnnP61807 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnnP61807 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnnP61807 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnnP61807 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnnP61807 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnnP61807 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnnP61807 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnnP61807 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SnnP61807 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnnP61807 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnnP61807 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnnP61807 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnnP61807 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnnP61807 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SnnP61807 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SnnP61807 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnnP61807 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnnP61807 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnnP61807 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SnnP61807 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnnP61807 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnnP61807 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnnP61807 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnnP61807 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnnP61807 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnnP61807 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnnP61807 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnnP61807 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnnP61807 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnnP61807 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SnnP61807 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SnnP61807 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SnnP61807 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SnnP61807 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SnnP61807 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SnnP61807 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SnnP61807 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SnnP61807 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SnnP61807 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SnnP61807 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SnnP61807 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SnnP61807 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SnnP61807 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SnnP61807 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SnnP61807 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SnnP61807 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SnnP61807 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SnnP61807 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SnnP61807 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SnnP61807 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SnnP61807 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SnnP61807 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SnnP61807 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SnnP61807 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SnnP61807 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SnnP61807 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SnnP61807 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SnnP61807 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SnnP61807 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SnnP61807 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SnnP61807 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SnnP61807 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SnnP61807 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SnnP61807 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SnnP61807 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SnnP61807 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SnnP61807 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SnnP61807 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SnnP61807 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SnnP61807 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SnnP61807 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SnnP61807 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SnnP61807 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SnnP61807 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SnnP61807 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SnnP61807 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SnnP61807 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SnnP61807 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SnnP61807 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SnnP61807 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SnnP61807 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SnnP61807 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SnnP61807 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SnnP61807 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SnnP61807 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SnnP61807 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SnnP61807 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnnP61807 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnnP61807 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnnP61807 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnnP61807 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnnP61807 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnnP61807 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnnP61807 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnnP61807 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnnP61807 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnnP61807 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SnnP61807 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnnP61807 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms