Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hps5P59438 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hps5P59438 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hps5P59438 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Hps5P59438 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hps5P59438 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hps5P59438 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hps5P59438 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hps5P59438 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Hps5P59438 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Hps5P59438 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hps5P59438 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hps5P59438 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hps5P59438 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hps5P59438 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hps5P59438 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hps5P59438 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hps5P59438 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hps5P59438 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hps5P59438 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hps5P59438 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hps5P59438 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hps5P59438 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hps5P59438 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hps5P59438 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hps5P59438 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hps5P59438 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hps5P59438 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hps5P59438 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hps5P59438 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hps5P59438 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hps5P59438 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hps5P59438 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hps5P59438 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hps5P59438 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hps5P59438 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hps5P59438 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hps5P59438 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hps5P59438 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hps5P59438 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hps5P59438 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hps5P59438 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hps5P59438 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hps5P59438 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hps5P59438 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hps5P59438 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hps5P59438 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hps5P59438 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hps5P59438 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hps5P59438 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hps5P59438 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hps5P59438 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hps5P59438 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hps5P59438 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hps5P59438 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hps5P59438 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hps5P59438 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hps5P59438 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hps5P59438 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hps5P59438 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hps5P59438 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hps5P59438 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hps5P59438 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hps5P59438 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hps5P59438 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hps5P59438 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hps5P59438 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hps5P59438 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hps5P59438 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hps5P59438 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hps5P59438 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hps5P59438 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hps5P59438 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hps5P59438 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hps5P59438 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hps5P59438 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hps5P59438 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hps5P59438 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hps5P59438 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hps5P59438 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hps5P59438 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hps5P59438 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Hps5P59438 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hps5P59438 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hps5P59438 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Hps5P59438 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Hps5P59438 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Hps5P59438 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hps5P59438 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hps5P59438 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hps5P59438 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hps5P59438 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hps5P59438 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hps5P59438 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hps5P59438 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hps5P59438 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hps5P59438 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hps5P59438 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hps5P59438 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hps5P59438 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms