Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CckbrP56481 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CckbrP56481 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CckbrP56481 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CckbrP56481 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CckbrP56481 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CckbrP56481 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CckbrP56481 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CckbrP56481 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CckbrP56481 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CckbrP56481 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CckbrP56481 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CckbrP56481 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CckbrP56481 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CckbrP56481 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CckbrP56481 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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