Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CartptP56388 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CartptP56388 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CartptP56388 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CartptP56388 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CartptP56388 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CartptP56388 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CartptP56388 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CartptP56388 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CartptP56388 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CartptP56388 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CartptP56388 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CartptP56388 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CartptP56388 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CartptP56388 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CartptP56388 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CartptP56388 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CartptP56388 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CartptP56388 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CartptP56388 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CartptP56388 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CartptP56388 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CartptP56388 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CartptP56388 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CartptP56388 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CartptP56388 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CartptP56388 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CartptP56388 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CartptP56388 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CartptP56388 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CartptP56388 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CartptP56388 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CartptP56388 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CartptP56388 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CartptP56388 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CartptP56388 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CartptP56388 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CartptP56388 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CartptP56388 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CartptP56388 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CartptP56388 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CartptP56388 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CartptP56388 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CartptP56388 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CartptP56388 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CartptP56388 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CartptP56388 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CartptP56388 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CartptP56388 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CartptP56388 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CartptP56388 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CartptP56388 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CartptP56388 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CartptP56388 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CartptP56388 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CartptP56388 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CartptP56388 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CartptP56388 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CartptP56388 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CartptP56388 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CartptP56388 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CartptP56388 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CartptP56388 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CartptP56388 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CartptP56388 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CartptP56388 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CartptP56388 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CartptP56388 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CartptP56388 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CartptP56388 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CartptP56388 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CartptP56388 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CartptP56388 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CartptP56388 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CartptP56388 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CartptP56388 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CartptP56388 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CartptP56388 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CartptP56388 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CartptP56388 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CartptP56388 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CartptP56388 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CartptP56388 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CartptP56388 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CartptP56388 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CartptP56388 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CartptP56388 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CartptP56388 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CartptP56388 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CartptP56388 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CartptP56388 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CartptP56388 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CartptP56388 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CartptP56388 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CartptP56388 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CartptP56388 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CartptP56388 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CartptP56388 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CartptP56388 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CartptP56388 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms