Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NcanP55066 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NcanP55066 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NcanP55066 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NcanP55066 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NcanP55066 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NcanP55066 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NcanP55066 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NcanP55066 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NcanP55066 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NcanP55066 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NcanP55066 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NcanP55066 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NcanP55066 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NcanP55066 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NcanP55066 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NcanP55066 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NcanP55066 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NcanP55066 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NcanP55066 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NcanP55066 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NcanP55066 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NcanP55066 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NcanP55066 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NcanP55066 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NcanP55066 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NcanP55066 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NcanP55066 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NcanP55066 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NcanP55066 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NcanP55066 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NcanP55066 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NcanP55066 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NcanP55066 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NcanP55066 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NcanP55066 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NcanP55066 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NcanP55066 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NcanP55066 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NcanP55066 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NcanP55066 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NcanP55066 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NcanP55066 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NcanP55066 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NcanP55066 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NcanP55066 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NcanP55066 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NcanP55066 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NcanP55066 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NcanP55066 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NcanP55066 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NcanP55066 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NcanP55066 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NcanP55066 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NcanP55066 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NcanP55066 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NcanP55066 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NcanP55066 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NcanP55066 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NcanP55066 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NcanP55066 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NcanP55066 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NcanP55066 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NcanP55066 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NcanP55066 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NcanP55066 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NcanP55066 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NcanP55066 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NcanP55066 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NcanP55066 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NcanP55066 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NcanP55066 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NcanP55066 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NcanP55066 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NcanP55066 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NcanP55066 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NcanP55066 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NcanP55066 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NcanP55066 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NcanP55066 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NcanP55066 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NcanP55066 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NcanP55066 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NcanP55066 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NcanP55066 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NcanP55066 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NcanP55066 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NcanP55066 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NcanP55066 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NcanP55066 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NcanP55066 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NcanP55066 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NcanP55066 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NcanP55066 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NcanP55066 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NcanP55066 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NcanP55066 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NcanP55066 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NcanP55066 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NcanP55066 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms