Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cacnb3P54285 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cacnb3P54285 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cacnb3P54285 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cacnb3P54285 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cacnb3P54285 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cacnb3P54285 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cacnb3P54285 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cacnb3P54285 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cacnb3P54285 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cacnb3P54285 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cacnb3P54285 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cacnb3P54285 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cacnb3P54285 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cacnb3P54285 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cacnb3P54285 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cacnb3P54285 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cacnb3P54285 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cacnb3P54285 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cacnb3P54285 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cacnb3P54285 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cacnb3P54285 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cacnb3P54285 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cacnb3P54285 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cacnb3P54285 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cacnb3P54285 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cacnb3P54285 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cacnb3P54285 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cacnb3P54285 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cacnb3P54285 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cacnb3P54285 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cacnb3P54285 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cacnb3P54285 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms