Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epb42P49222 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epb42P49222 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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Epb42P49222 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epb42P49222 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epb42P49222 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms