Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TtlP38585 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TtlP38585 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TtlP38585 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TtlP38585 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TtlP38585 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TtlP38585 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TtlP38585 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TtlP38585 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TtlP38585 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TtlP38585 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TtlP38585 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TtlP38585 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TtlP38585 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TtlP38585 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TtlP38585 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TtlP38585 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TtlP38585 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TtlP38585 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TtlP38585 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TtlP38585 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TtlP38585 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TtlP38585 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TtlP38585 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TtlP38585 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TtlP38585 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TtlP38585 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TtlP38585 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TtlP38585 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TtlP38585 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TtlP38585 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TtlP38585 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TtlP38585 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TtlP38585 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TtlP38585 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TtlP38585 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TtlP38585 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TtlP38585 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TtlP38585 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TtlP38585 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TtlP38585 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TtlP38585 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TtlP38585 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TtlP38585 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TtlP38585 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TtlP38585 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TtlP38585 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TtlP38585 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TtlP38585 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TtlP38585 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TtlP38585 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TtlP38585 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TtlP38585 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TtlP38585 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TtlP38585 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TtlP38585 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TtlP38585 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TtlP38585 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TtlP38585 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TtlP38585 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TtlP38585 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TtlP38585 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TtlP38585 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TtlP38585 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TtlP38585 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TtlP38585 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TtlP38585 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TtlP38585 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TtlP38585 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TtlP38585 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TtlP38585 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TtlP38585 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TtlP38585 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TtlP38585 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TtlP38585 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TtlP38585 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TtlP38585 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TtlP38585 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TtlP38585 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TtlP38585 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TtlP38585 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TtlP38585 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TtlP38585 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TtlP38585 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TtlP38585 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TtlP38585 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TtlP38585 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TtlP38585 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TtlP38585 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TtlP38585 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TtlP38585 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TtlP38585 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TtlP38585 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TtlP38585 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TtlP38585 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TtlP38585 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TtlP38585 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TtlP38585 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TtlP38585 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TtlP38585 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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