Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Grin1P35438 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Grin1P35438 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Grin1P35438 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Grin1P35438 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grin1P35438 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grin1P35438 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grin1P35438 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Grin1P35438 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grin1P35438 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms