Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CTNNB1P35222 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTNNB1P35222 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTNNB1P35222 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTNNB1P35222 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTNNB1P35222 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTNNB1P35222 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTNNB1P35222 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CTNNB1P35222 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CTNNB1P35222 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CTNNB1P35222 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
CTNNB1P35222 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CTNNB1P35222 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CTNNB1P35222 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CTNNB1P35222 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CTNNB1P35222 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTNNB1P35222 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms