Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Saa4P31532 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Saa4P31532 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Saa4P31532 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Saa4P31532 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Saa4P31532 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Saa4P31532 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Saa4P31532 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Saa4P31532 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms