Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXA13P31271 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
HOXA13P31271 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
HOXA13P31271 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
HOXA13P31271 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
HOXA13P31271 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
HOXA13P31271 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
HOXA13P31271 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXA13P31271 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms