Protein–RNA interactions for Protein: P30873

Sstr1, Somatostatin receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sstr1P30873 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Sstr1P30873 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sstr1P30873 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms