Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

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Length 674 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkcdP28867 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkcdP28867 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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