Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

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Length 369 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BgnP28653 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BgnP28653 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BgnP28653 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BgnP28653 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BgnP28653 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BgnP28653 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BgnP28653 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BgnP28653 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BgnP28653 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BgnP28653 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BgnP28653 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BgnP28653 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BgnP28653 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BgnP28653 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BgnP28653 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BgnP28653 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BgnP28653 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BgnP28653 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BgnP28653 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BgnP28653 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BgnP28653 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BgnP28653 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BgnP28653 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BgnP28653 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BgnP28653 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BgnP28653 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BgnP28653 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BgnP28653 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BgnP28653 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
BgnP28653 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BgnP28653 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BgnP28653 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BgnP28653 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BgnP28653 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BgnP28653 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BgnP28653 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BgnP28653 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BgnP28653 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BgnP28653 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BgnP28653 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BgnP28653 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BgnP28653 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
BgnP28653 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
BgnP28653 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BgnP28653 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
BgnP28653 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BgnP28653 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BgnP28653 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
BgnP28653 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BgnP28653 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
BgnP28653 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BgnP28653 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BgnP28653 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BgnP28653 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BgnP28653 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BgnP28653 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
BgnP28653 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
BgnP28653 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BgnP28653 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BgnP28653 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BgnP28653 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BgnP28653 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
BgnP28653 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BgnP28653 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BgnP28653 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BgnP28653 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BgnP28653 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BgnP28653 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BgnP28653 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BgnP28653 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BgnP28653 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BgnP28653 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BgnP28653 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BgnP28653 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BgnP28653 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BgnP28653 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BgnP28653 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BgnP28653 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
BgnP28653 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BgnP28653 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BgnP28653 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BgnP28653 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BgnP28653 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BgnP28653 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BgnP28653 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BgnP28653 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BgnP28653 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BgnP28653 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BgnP28653 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BgnP28653 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BgnP28653 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BgnP28653 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BgnP28653 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BgnP28653 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BgnP28653 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BgnP28653 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
BgnP28653 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BgnP28653 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BgnP28653 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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