Protein–RNA interactions for Protein: P28235

Gja4, Gap junction alpha-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja4P28235 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja4P28235 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja4P28235 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja4P28235 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja4P28235 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja4P28235 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja4P28235 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja4P28235 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gja4P28235 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gja4P28235 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gja4P28235 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms