Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gjb3P28231 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms