Protein–RNA interactions for Protein: P27641

Xrcc5, X-ray repair cross-complementing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc5P27641 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Xrcc5P27641 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Xrcc5P27641 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Xrcc5P27641 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Xrcc5P27641 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Xrcc5P27641 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Xrcc5P27641 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Xrcc5P27641 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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