Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Hoxd8P23463 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Hoxd8P23463 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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