Protein–RNA interactions for Protein: P22387

Edn1, Endothelin-1, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edn1P22387 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Edn1P22387 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Edn1P22387 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Edn1P22387 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Edn1P22387 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Edn1P22387 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Edn1P22387 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Edn1P22387 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Edn1P22387 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Edn1P22387 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Edn1P22387 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Edn1P22387 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Edn1P22387 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Edn1P22387 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Edn1P22387 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Edn1P22387 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Edn1P22387 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Edn1P22387 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Edn1P22387 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Edn1P22387 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Edn1P22387 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Edn1P22387 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Edn1P22387 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Edn1P22387 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Edn1P22387 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Edn1P22387 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Edn1P22387 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Edn1P22387 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Edn1P22387 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Edn1P22387 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Edn1P22387 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Edn1P22387 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Edn1P22387 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Edn1P22387 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Edn1P22387 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Edn1P22387 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Edn1P22387 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Edn1P22387 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Edn1P22387 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Edn1P22387 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Edn1P22387 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Edn1P22387 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Edn1P22387 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Edn1P22387 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Edn1P22387 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Edn1P22387 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Edn1P22387 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Edn1P22387 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Edn1P22387 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Edn1P22387 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Edn1P22387 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Edn1P22387 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Edn1P22387 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Edn1P22387 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Edn1P22387 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Edn1P22387 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Edn1P22387 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Edn1P22387 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Edn1P22387 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Edn1P22387 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Edn1P22387 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Edn1P22387 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Edn1P22387 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Edn1P22387 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Edn1P22387 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Edn1P22387 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Edn1P22387 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Edn1P22387 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Edn1P22387 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Edn1P22387 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Edn1P22387 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Edn1P22387 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Edn1P22387 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Edn1P22387 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Edn1P22387 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Edn1P22387 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Edn1P22387 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms