Protein–RNA interactions for Protein: P18828

Sdc1, Syndecan-1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc1P18828 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdc1P18828 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms