Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P18529 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P18529 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P18529 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
P18529 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P18529 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P18529 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P18529 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P18529 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P18529 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P18529 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
P18529 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
P18529 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
P18529 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P18529 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P18529 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P18529 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P18529 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P18529 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
P18529 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P18529 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
P18529 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
P18529 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P18529 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P18529 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
P18529 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
P18529 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
P18529 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P18529 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P18529 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P18529 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P18529 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P18529 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P18529 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P18529 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P18529 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
P18529 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18529 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18529 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18529 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18529 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18529 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18529 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18529 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18529 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18529 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18529 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18529 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18529 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18529 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18529 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18529 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18529 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18529 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18529 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18529 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18529 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18529 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
P18529 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18529 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18529 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18529 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
P18529 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18529 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18529 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
P18529 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18529 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18529 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18529 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18529 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18529 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18529 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18529 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18529 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18529 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18529 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18529 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18529 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18529 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18529 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18529 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18529 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18529 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18529 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18529 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18529 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18529 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18529 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18529 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18529 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18529 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18529 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18529 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18529 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18529 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
P18529 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18529 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18529 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18529 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18529 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms