Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms