Protein–RNA interactions for Protein: O35914

Bnc1, Zinc finger protein basonuclin-1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc1O35914 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Bnc1O35914 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bnc1O35914 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Bnc1O35914 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bnc1O35914 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bnc1O35914 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bnc1O35914 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bnc1O35914 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Bnc1O35914 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bnc1O35914 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bnc1O35914 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bnc1O35914 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bnc1O35914 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms