Protein–RNA interactions for Protein: O35646

Capn6, Calpain-6, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn6O35646 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn6O35646 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn6O35646 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn6O35646 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn6O35646 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn6O35646 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn6O35646 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn6O35646 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn6O35646 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn6O35646 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn6O35646 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn6O35646 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn6O35646 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn6O35646 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn6O35646 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn6O35646 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn6O35646 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn6O35646 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn6O35646 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms