Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
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Opn1mwO35599 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Opn1mwO35599 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Opn1mwO35599 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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