Protein–RNA interactions for Protein: O35074

Ptgis, Prostacyclin synthase, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgisO35074 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtgisO35074 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtgisO35074 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtgisO35074 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtgisO35074 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PtgisO35074 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtgisO35074 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtgisO35074 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtgisO35074 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtgisO35074 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtgisO35074 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtgisO35074 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtgisO35074 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtgisO35074 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtgisO35074 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PtgisO35074 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtgisO35074 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtgisO35074 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtgisO35074 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtgisO35074 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtgisO35074 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PtgisO35074 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtgisO35074 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtgisO35074 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PtgisO35074 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PtgisO35074 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtgisO35074 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtgisO35074 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtgisO35074 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtgisO35074 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtgisO35074 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtgisO35074 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtgisO35074 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtgisO35074 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtgisO35074 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtgisO35074 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtgisO35074 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtgisO35074 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtgisO35074 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtgisO35074 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtgisO35074 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtgisO35074 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtgisO35074 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtgisO35074 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtgisO35074 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtgisO35074 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtgisO35074 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtgisO35074 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtgisO35074 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtgisO35074 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtgisO35074 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtgisO35074 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtgisO35074 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtgisO35074 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtgisO35074 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtgisO35074 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtgisO35074 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtgisO35074 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtgisO35074 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtgisO35074 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtgisO35074 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtgisO35074 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtgisO35074 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtgisO35074 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtgisO35074 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtgisO35074 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtgisO35074 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtgisO35074 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtgisO35074 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtgisO35074 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtgisO35074 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtgisO35074 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtgisO35074 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtgisO35074 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtgisO35074 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtgisO35074 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtgisO35074 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtgisO35074 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtgisO35074 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtgisO35074 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtgisO35074 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtgisO35074 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtgisO35074 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtgisO35074 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtgisO35074 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtgisO35074 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtgisO35074 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtgisO35074 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtgisO35074 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PtgisO35074 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtgisO35074 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtgisO35074 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PtgisO35074 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PtgisO35074 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PtgisO35074 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PtgisO35074 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtgisO35074 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtgisO35074 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PtgisO35074 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PtgisO35074 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms