Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Casq1O09165 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Casq1O09165 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Casq1O09165 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casq1O09165 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Casq1O09165 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Casq1O09165 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Casq1O09165 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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