Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
MsmbO08540 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
MsmbO08540 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
MsmbO08540 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
MsmbO08540 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
MsmbO08540 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
MsmbO08540 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
MsmbO08540 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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