Protein–RNA interactions for Protein: L7N257

BC117090, cDNA sequence BC1179090, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC117090L7N257 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BC117090L7N257 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
BC117090L7N257 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
BC117090L7N257 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BC117090L7N257 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
BC117090L7N257 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BC117090L7N257 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BC117090L7N257 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
BC117090L7N257 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC117090L7N257 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC117090L7N257 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC117090L7N257 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC117090L7N257 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
BC117090L7N257 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC117090L7N257 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
BC117090L7N257 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC117090L7N257 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC117090L7N257 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC117090L7N257 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC117090L7N257 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC117090L7N257 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC117090L7N257 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC117090L7N257 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC117090L7N257 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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BC117090L7N257 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
BC117090L7N257 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC117090L7N257 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC117090L7N257 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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BC117090L7N257 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC117090L7N257 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC117090L7N257 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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BC117090L7N257 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC117090L7N257 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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BC117090L7N257 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC117090L7N257 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC117090L7N257 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC117090L7N257 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BC117090L7N257 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BC117090L7N257 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BC117090L7N257 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BC117090L7N257 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BC117090L7N257 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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BC117090L7N257 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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BC117090L7N257 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BC117090L7N257 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BC117090L7N257 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BC117090L7N257 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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BC117090L7N257 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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BC117090L7N257 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BC117090L7N257 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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BC117090L7N257 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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BC117090L7N257 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BC117090L7N257 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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BC117090L7N257 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC117090L7N257 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC117090L7N257 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC117090L7N257 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC117090L7N257 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC117090L7N257 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC117090L7N257 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC117090L7N257 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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BC117090L7N257 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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BC117090L7N257 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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