Protein–RNA interactions for Protein: K9J7E2

Gm4312, Predicted gene 4301, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4312K9J7E2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm4312K9J7E2 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm4312K9J7E2 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm4312K9J7E2 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm4312K9J7E2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm4312K9J7E2 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm4312K9J7E2 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm4312K9J7E2 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm4312K9J7E2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm4312K9J7E2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm4312K9J7E2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm4312K9J7E2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm4312K9J7E2 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm4312K9J7E2 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm4312K9J7E2 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm4312K9J7E2 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm4312K9J7E2 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm4312K9J7E2 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm4312K9J7E2 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm4312K9J7E2 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm4312K9J7E2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm4312K9J7E2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm4312K9J7E2 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm4312K9J7E2 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm4312K9J7E2 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm4312K9J7E2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm4312K9J7E2 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm4312K9J7E2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm4312K9J7E2 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm4312K9J7E2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm4312K9J7E2 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm4312K9J7E2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm4312K9J7E2 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm4312K9J7E2 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm4312K9J7E2 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm4312K9J7E2 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm4312K9J7E2 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm4312K9J7E2 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm4312K9J7E2 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm4312K9J7E2 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm4312K9J7E2 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm4312K9J7E2 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm4312K9J7E2 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm4312K9J7E2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm4312K9J7E2 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm4312K9J7E2 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm4312K9J7E2 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm4312K9J7E2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm4312K9J7E2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gm4312K9J7E2 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gm4312K9J7E2 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm4312K9J7E2 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm4312K9J7E2 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm4312K9J7E2 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm4312K9J7E2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm4312K9J7E2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm4312K9J7E2 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm4312K9J7E2 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm4312K9J7E2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm4312K9J7E2 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm4312K9J7E2 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm4312K9J7E2 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm4312K9J7E2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm4312K9J7E2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm4312K9J7E2 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm4312K9J7E2 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm4312K9J7E2 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm4312K9J7E2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm4312K9J7E2 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm4312K9J7E2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm4312K9J7E2 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm4312K9J7E2 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm4312K9J7E2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm4312K9J7E2 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm4312K9J7E2 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm4312K9J7E2 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm4312K9J7E2 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm4312K9J7E2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm4312K9J7E2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm4312K9J7E2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm4312K9J7E2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm4312K9J7E2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm4312K9J7E2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm4312K9J7E2 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm4312K9J7E2 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm4312K9J7E2 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm4312K9J7E2 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm4312K9J7E2 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm4312K9J7E2 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm4312K9J7E2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm4312K9J7E2 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm4312K9J7E2 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm4312K9J7E2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm4312K9J7E2 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm4312K9J7E2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm4312K9J7E2 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm4312K9J7E2 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm4312K9J7E2 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm4312K9J7E2 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm4312K9J7E2 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms