Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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