Protein–RNA interactions for Protein: F6U3N7

Gm21977, Predicted gene 21977 (Fragment), mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21977F6U3N7 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21977F6U3N7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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