Protein–RNA interactions for Protein: F6TQD1

Rnf212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf212F6TQD1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
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Rnf212F6TQD1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Rnf212F6TQD1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Rnf212F6TQD1 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Rnf212F6TQD1 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Rnf212F6TQD1 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
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Rnf212F6TQD1 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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