Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E9

Krtap11-1, Keratin-associated protein 11-1, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap11-1E9Q2E9 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms