Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1T6

Lrp3, Low density lipoprotein receptor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp3E9Q1T6 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrp3E9Q1T6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms